_Tun Mutahir berkahwin dengan 3 orang isteri iaitu:

PERTAMA:
Tunku Chik binti Sultan Ahmad Tajuddin Halim Shah II (Sultan Kedah), Sultan yang memerintah negeri Kedah sebanyak dua kali, iaitu pada tahun 1803-1821 Masihi, dan 1842-1845 Masihi. Daripada perkahwinan baginda dengan seorang wanita Siam dari Ligor iaitu Che' Alraseh, telah melahirkan  tujuh putera dan tiga puteri, salah seorangnya Tunku Chik yang berkahwin dengan Tun Mutahir. Putera baginda yang bernama  Tunku Zain al-Rashid kemudian naik takhta menggantikan ayahandanya sebagai Sultan Zain al-Rashid al-Muadzam Shah I (1845-1854), melahirkan seorang bangsawan Melayu terkenal iaitu Tunku Dziauddin atau Tunku Kudin.

Perkahwinan Tunku Chik binti Sultan Ahmad Tajuddin (Kedah) dengan Tun Mutahir telah melahirkan dua orang putera dan seorang puteri, iaitu Tun Koris, Tun Abdul Rahman dan Tun Chik. Sila klik pada laman berkaitan.

KEDUA:
Tengku Chik binti Sultan Muhammad Shah (Sultan Johor Lama di Lingga) dan

KETIGA:
Tengku Kechik binti Sultan Abdul Rahman (Sultan Johor Lama di Lingga)